Храни секрет тайна

Диэдральные или торсионные углы

Название пугающее, но сейчас как устроим этим углам! Так, мы уже говорили о том, что вокруг пептидной связи не повращаться из-за того, что она частично двойная. Но ведь есть и другие связи, вокруг которых можно устроить веселуху.

Вращение вокруг связей

Понимаю, что представить это не так уж и легко, но можно попробовать сделать! Получится конечно не совсем так, но принцип поймем. Возьмем ручку и два колпачка, засунем бумажку под каждый колпачок и начнем крутить. Условимся, что мои пальцы — альфа-углеродный атом, то есть место пересечения двух плоскостей.

Теперь мы поняли, как происходит вращение, но это еще не все. Существуют определенные углы между плоскостями и всего их два. Представьте, что нам захочется найти угол между углеродами, у которых карбоксильная группа, двух плоскостей. Или угол между двумя атомами азота, опять же, двух разных плоскостей. Задачка кажется сложной… Но перед этим, а зачем я вообще мучаю вас этим? Дело в том, что когда мы дойдем до конформации белковых молекул, то благодаря этим углам мы поймем: как и почему образуется альфа-спираль, тоже самое с бета-складчатостью. Так что потерпите немного!

Углы между атомами в пептидах

Если посмотреть на эту схему, то можно кое-что прикинуть: если мы будем вращать связь между N и C, то углерод с карбоксильной группой изменит положение относительно углерода другой плоскости, а вот азот останется на том же месте — угол между двумя азотами не изменится. А вот если начнем вращать связь между C и C, то все будет наоборот: угол между азотами изменится, но вот углероды с карбоксильной группой останутся на месте. Сложновато, но чуть дальше я дам пространственную картинку. Пока что мы пришли к выводу, что связь между N и C влияет на угол между углеродами — этот угол называется фи. А вот связь между C и C влияет на угол между атомами азота — угол пси.

Теперь можно и добавить атомы водорода в схему, они скоро нам понадобятся.

Фи и пси углы

Добавим реалистичности, центральным радикалом у нас будет -CH3, а остальные радикалы уберем.

Торсионные углы в пептидах. Первая картинка с https://proteopedia.org/wiki/index.php/Tutorial:Ramachandran_principle_and_phi_psi_angles

А теперь главный вопрос — как измерить эти углы? Хорошо, что уже это придумали… И мы можем сделать это вместе — заходите сюда и поехали! Первым делом нам нужно перевернуть молекулу так, чтобы расположить атом углерода с карбоксильной группой сверху. Зачем такие выкрутасы? Расскажу позже. А теперь посмотрим прямо в альфа атом углерода, да так что за ним спрятался азот. Как-то это странно звучит, но давайте попробуем.

Еще это можно посмотреть графически с помощью проекций Ньюмана.

Проекция Ньюмана

Так, повторим что такое угол фи — это угол между двумя карбоксильными атомами углерода. На рисунке уже их видно.

Угол фи — 165 градусов

Поняли зачем так крутили молекулу? Да, просто так нам удобнее смотреть угол. А теперь начнем вращать и посмотрим как меняются углы.

Изменение углов фи при вращении вокруг связи

Угол пси по такой же логике. Крутим молекулу, чтобы атом азота оказался сверху и смотрим прямо в альфа атом углерода.

Еще разок построим проекцию Ньюмана, она немного отличается, и сразу же отметим углы.

Торсионный угол пси

Думаю, что принцип понятен. Дальше можете покрутить сами, правильно? Я не сказал про одно большое «НО» — не каждый угол возможен, так как у атомов есть, которые заряжены отрицательно. Если электронные оболочки подходят слишком близко, то они отталкиваются и угол меняется. Какие углы возможны? Для этого еще разок зайдите сюда и включите на панельке справа силы Ван-дер-Вальса и show clashes.

Подробнее о влиянии этих углов в следующей статье.

Хочешь задать вопрос, похвалить или наговорить гадостей? Тогда залетай в телегу. Там ты сможешь предложить новый формат или разбор темы. А если серьёзно, то эти статьи пишутся для вас, поэтому мне важна обратная связь.

АминокислоткиСкачать

Сервисы, если шаблон уже есть

Помимо использования сервисов для создания мемов, можно найти нужный шаблон в интернете и вставить текст в фотошопе, пейнте или в любом онлайн-редакторе изображений. Например, в том же ВКонтакте существует целый ряд групп, в которых собирают шаблоны для мемов без текста.

Вот самые крупные:

  • Пустые мемы
  • ШДМ
  • Шаблоны для мемов

А где удобнее добавить текст на шаблон? Во-первых, на любом из сайтов, которые мы перечислили выше. Во-вторых, есть еще несколько полезных сервисов и один лайфхак.

Начнем с лайфхака. Если нужно нанести текст на картинку, это легко сделать в редакторе фото во ВКонтакте. Для этого загрузите картинку в сообщения или на стену — удобнее всего прислать шаблон себе в Избранное. Откройте фоторедактор, выберите инструмент Надпись и добавляйте текст.

Плюсы: доступны 8 шрифтов, среди которых есть главные мемные шрифты, очень простой интерфейс, а при сохранении мема — нет водяного знака.

Пять эффективных тактик привлечения клиентов через СМИ
Пошаговое руководство с примерами и пояснениями Скачать книгу

И еще несколько сервисов на заметку.

  • Make a Meme: загрузите изображение, добавьте текст в поля ввода, а затем нажмите кнопку «Make a meme». Дополнительные функции для форматирования текста и сохранение без водяного знака доступны только после регистрации.
  • Clideo: простой редактор для работы с шаблонами. В вашем распоряжении 2 текстовых блока и 12 шрифтов на выбор. Из интересного — при необходимости картинка обрезается под форматы Инстаграма, Ютуба и Фейсбука.
  • Canva — полноценный графический онлайн-редактор. Загружайте основу для мема, добавляйте любое количество надписей и желаемые эффекты. В бесплатной версии есть ограничения по количеству шрифтов и эффектам, но их достаточно, чтобы сделать мем.

Зачем вообще нужны мемы

Мем — это смешная картинка в интернете. А смешной ее может сделать практически что угодно: знакомая или абсурдная ситуация, показанная в меме, или уморительное сочетание надписи и иллюстрации. Главное правило хорошего мема — он моментально разлетается по социальным сетям. Обычно выстреливает одна картинка, а на ее основе люди начинают создавать свои мемы. 

Если говорить о маркетинге, то мемы разнообразят социальные сети бренда или статьи в блоге

Они повышают вовлеченность и лояльность аудитории, привлекают внимание к контенту. Даже если человек пришел в соцсети или блог компании, чтобы получить полезную информацию, он все равно будет рад посмеяться над чем-то

Конечно, только если мем вписывается в тему материала или поста.

Вот типичный мем про работу маркетолога:

Приложения для смартфона

Если гениальная идея для мема возникла в голове внезапно, а вам очень хочется сразу поделиться ей со всем интернетом — быстро сделайте мем в мобильном приложении.

10. Meme Generator Free

Приложение доступно как для Android, так и для iOS. Большая коллекция мемов делится на категории, есть удобный поиск и подборка новых и популярных картинок, любимые мемы можно сохранить в Избранное. Интерфейс простой и понятный, пользоваться приложением удобно.

11. Mematic

Работает на Android и iOS. Нужный шаблон можно найти в библиотеке, но поиск не продуманный — нет ни категорий, ни рубрик. Лучше приходить в приложение со своей картинкой и добавлять на нее текст. Большинство стандартных функций в наличии, хотя местами интерфейс сложный — приходится методом проб и ошибок создавать свой мем. Если разобраться во всех настройках и возможностях, то приложение вполне рабочее.

12. Мемасик

Простое приложение для Android и iOS с хорошей библиотекой мемов и понятным интерфейсом. Более того, это фактически социальная сеть — пользователи регистрируются, делают свои мемы и выкладывают в общую ленту. Разумеется, мемы лайкают и комментируют, и каждый создатель мема надеется, что его творение оценят по достоинству. При этом ленту могут смотреть и незарегистрированные владельцы приложения, но оставлять реакции — только те, у кого уже есть аккаунт.

Приложение предлагает бесплатный доступ и VIP-тариф. Мемы VIP-пользователей держатся в топе ленты, и у таких аккаунтов появляется много других преимуществ.

13. Мeme

Приложение только для iOS. Пользователя ждет внушительная коллекция шрифтов, стикеров и эмодзи — понравится тем, кто хочет создавать очень фантазийные истории. Часть коллекции доступна только в платной подписке, но большинству хватает и бесплатных функций.

14. Meme Creator

Приложение для Android. Более 600 шаблонов, разделенные на 6 категорий, 20 шрифтов на выбор, возможность загружать свои картинки. Минусы: на любой шаблон автоматически вставляются два текстовых блока — сверху и снизу. При желании один можно оставить пустым, но добавить третью реплику нельзя, а сами блоки не передвигаются.

Изоэлектрическая точка

Вы уже заметили, что у аминокислот есть положительная и отрицательная части. Не так много молекул имеют такую особенность. Так что аминокислоты — это такой гибрид, поэтому их так и назвали — гибридные ионы. Правда на немецком…. А звучит это так: «Цвиттер-ион». Но как всегда есть один нюанс — у гибридного иона общий заряд молекулы равен нулю.


Цвиттер-ион

И вы уже смекнули, что не у всех аминокислот будет общий заряд равен нулю. Для неполярных и полярных незаряженных аминокислот это верно, но че делать с заряженными? До этого мы разбирали заряд аминокислот в клетке, то есть при нейтральном pH. Но что будет с ними, если поместить их в другие значения среды, например, в сильнощелочную или кислотную? Аминокислоты будут менять свой заряд и сейчас посмотрим как.

Для начала возьмем что-нибудь простенькое — пусть это будет глицин. Начинаем добавлять по капельке кислоту, и сначала ничего не меняется. Но при значении pH=2,34 карбоксильная группа глицина присоединит протон водорода. Что же получается? Заряд молекулы изменился — теперь он равен +1. Начнем добавлять к этому же раствору щелочь по капле. Дойдем до pH равного 9,6 и от аминогруппы глицина отлетит водород. Заряд молекулы будет -1.

Изменение заряда молекулы глицина

Думаю, что нужно кое-что уточнить. Вы понимаете, что эти реакции обратимы

Когда я добавляю кислоту или щелочь, неважно, то я смещаю реакцию в какую-то сторону. Пусть я добавляю кислоту

С каждой каплей реакция смещается в сторону образования глицина +1, но только при pH равном 2,34 в растворе будет большая часть глицина +1. Хотя на pH +3 большая часть будет глицина с зарядом 0. Надеюсь, что понятно объяснил.

Как же назвать pH при котором происходит переход из одной формы в другую? Очень просто, показатель константы диссоциации или pKa. Химики не корите, не слишком точно конечно, но запомнить легче. Получается, что в молекуле глицина pKa карбоксильной группы=2,34, а pKa аминогруппы=9,6. Я написал про молекулу глицина, потому что в остальных аминокислотах значения немного отличаются.

А теперь о том, ради чего все это затевалось — изоэлектрическая точка.

Изоэлектрическая точка — это pH среды, при которой заряд молекулы равен нулю. Да, вот так вот просто. Ее, кстати, можно посчитать — для этого нужно сложить pKa двух ближних функциональных групп и поделить на их количество. А их количество — две.

Изоэлектрическая точка глицина

Сделаем тоже самое с молекулами посложнее, начнем с гистидина.

Изоэлектрическая точка гистидина. Для подсчета берём pKa радикала и аминогруппы — они ближе всего к изоэлектрической точке.

У гистидина есть заряженная группа, поэтому у него побольше вариантов заряда, чем у глицина. Мы видим, что у гистидина карбоксильная группа присоединяет водород при pH =1,82, а аминогруппа отдает протон водорода при pH=9,17. Вот про эти отличия я и говорил до этого, но так-то они не слишком большие. Радикал же отдает протон водорода при pH=6.

Сделаем тоже самое с глутаматом.

Изоэлектрическая точка глутамата. Для подсчёта берём pKa карбоксильной группы и радикала.

Думаю, что смысл понятен. У каждой аминокислоты своя собственная изоэлектрическая точка. Точки уже давно подсчитаны — достаточно найти их в интернете.

Сделаем красивый вывод:

Зачем это нужно? Ну давайте посмотрим. Мы знаем, что каждая аминокислота несет определенный заряд, но этот заряд меняется от pH среды. Если мы поместим аминокислоты в нейтральную среду и закинем туда катод и анод, то положительно заряженные аминокислоты направятся к аноду, а отрицательные к катоду. Остальные аминокислоты можно будет разделить с помощью изменения pH среды, ведь в изоэлектрической точке у аминокислоты не будет заряда. Нет заряда — нет движения к катоду или аноду, аминокислота стоит на месте. Вот мы и разделили аминокислоты в растворе, можно их изучить.

Глава 1. Случайности не случайны

Визги, шум, давка, ослепляющие вспышки телефонных камер, сующиеся под нос блокноты с ручками. Одной такой чуть не ткнули Вишне в глаз. Спасли солнцезащитные очки, но, видимо, пора переходить на противогаз. Для надёжности.

― Мистерия! Ты потрясающая! ― скандировала обступившая её толпа.

― Можно твой автограф?

― Можно с тобой сфотографироваться?

― Я тебя обожаю!

― Ты лучшая!

― Я твоя фанатка!

― У меня есть подушка с твоим фото! Каждый вечер я желаю тебе сладких снов!

Вишня от изумления заблудилась в неудобных каблуках и чуть не поприветствовала носом пол. А вот это уже жутковато. Потому она и выбрала существование инкогнито, спрятавшись за париками и очками. Не хотелось бы думать, что твоя моська красуется у кого попало, где попало и на чём попало. Популярность ― это, конечно, очень круто, но не когда вмешивается в личную жизнь.

Блин! Да как же незаметно улизнуть? Тима прав, пора обзаводиться охраной, а она всё: «нет, не надо, не буду, я че, Кэтти Пэрри? Кому я нафиг сдалась?». И вообще, почему аэропорты такие многолюдные и открытые? Потайных уголков вообще нет! Не в дютике (прим. авт. Дьюти Фри) же прятаться! Об этом и многом другом, включая новые натирающие туфли, думала Вишня, пытаясь протолкнуться через окружившую её толпу поклонников.

Кто-то, вероятно девчушка лет тринадцати, летящая с отцом в том же бизнес классе, что и она, узнала её и запилила пост на сайте Мистерии. Потому что спустилась с самолёта Вишня без проблем, таможенный контроль прошла тоже вполне спокойно, зато после на неё как по команде налетела стайка бешеных птичек. Да, всего человек в пятнадцать, однако и трое порой ведут себя не хуже толпы.

Вишня, конечно, сама сглупила. О билетах заранее не подумала, а когда очухалась было поздно. Пришлось припрячь Тиму, он же Тимур, её продюсер. Для Мистерии, а именно под этим псевдонимом Вишня Багрова (да-да, именно так она и значилась в паспорте, у родителей было просто отпадное чувство юмора) вот уже почти год покоряла сценический Олимп, место нашлось без труда. Зато сейчас вон, все шероховатости повылезали.

Просто раньше такого ажиотажа не было. Правда она и не светилась особо. Так, от дверей звукозаписывающей компании до арендованной машины, а там быстренько парик стянул, кофточку с блёстками на неприметную маечку сменил, и ты резко перестаёшь кому-либо быть нужной.

Вишня, пригибаясь за стойками, стремительно преодолела магазин, игнорируя пока не понявших в чём дело покупателей, выскочила со второго выхода и свернула в закоулок, под потолком которого подсвечивались таблички с опознавательными значками общественного туалета.

Из женского уже издалека слышался шум сушилки, так что, особо не думая, как это будет выглядеть, Вишня завернула в сторону мужского. Никого. Удача! Защёлкнув изнутри задвижку, она облегчённо облокотилась на дверцу кабинки, стягивая с головы ярко-жёлтый парик. Господи, как же под ним всё чесалось, кто бы знал!

Ладно. Нечего засиживаться. Тем более что мужские туалеты весьма специфично пахли, даже после частых уборок. Из женской бездонной сумки-мешка начали поспешно вытряхиваться запасные вещи. Джинсы, футболка, кроссовки ― всё самое обычное и неприметное. Конечно, это же не платье с пайетками, которое и слепой издалека узрит.

Джинсы натягивались с трудом. Да и прыгать на одной ноге в тесном пространстве было не очень удобно даже с её скромными габаритами и ростом. Хлопнула дверь. Послышались шаги. Кто-то зашёл. Вишня притаилась, вжимаясь в дверцу. Зря. Задвижка, видимо, где-то соскочила и звезда ютуба эффектно улетела на кафельный пол.

Молодой парень, наверное, её ровесник, забыл про включённый кран, льющуюся воду и намыленные руки. Вместо этого он с высоко поднятой бровью разглядывал вывалившуюся из кабинки девушку в платье с задранной ногой, на которой болталась недоодетая штанина. Не каждый день увидишь такое зрелище.

― Ёбушки-воробушки, ― прохрипела Вишня, у которой от жёсткого приземления аж дыхание спёрло. Она с трудом приподнялась на локтях, смахивая упавшие на лицо каштановые пряди и встречаясь с парнем взглядом. Вот же блин! ― Получится сделать вид, что никто ничего не видел?

― А надо? Такую картину сложно вымыть из памяти, ― по-доброму, без злорадства, усмехнулся тот, выставляя напоказ очаровательные ямочки. Да и сам он был весьма и весьма: в меру подтянут, в меру высок. И глаза красивые, ярко-голубые, этакие задорные васильки. Они сейчас смеялись вместе с хозяином.

Строение аминокислот

По названию все понятно, аминокислота — это молекула, которая содержит аминогруппу и карбоксильную группу. Но посмотрите на центральный углерод, что за бабник? У него целых четыре разных заместителя — водород, аминогруппа, карбоксильная группа и радикал. Он называется…. Альфа-углерод, такой альфа-самец прямо.

Строение аминокислот

Такое общее строение у всех аминокислот, которые входят в состав белков, но они кое-чем отличаются. Да-да, радикалом. Основных аминокислот — 20 штук, хотя если честно, то 19. А если еще честнее, то их больше, но не будем путаться. У одной аминокислоты особенное строение, она даже не аминокислота вовсе, а иминокислота. Вот наша легенда — пролин.  

Пролин

Вернемся к различиям между аминокислотами. Есть несколько классификаций радикалов, но мы возьмем самую полезную для нас — по полярности. А если говорить простыми словами, то по растворимости радикала в воде. И тут все очень логично — радикалы делятся на неполярные и полярные. Первые нерастворимы в воде, а вторые растворимы. Когда будем говорить о строении белка, то поймем почему нас интересует только эта классификация.

Неполярные радикалы аминокислот

У этих ребят нет групп, которые могут образовать водородные связи с водой, поэтому они нерастворимы. Вместо этого у них есть алифатические и ароматические группы. Радикалы выделены фиолетовым цветом.

Строение неполярных аминокислот

Опа, а глицин то получается не альфа-самец, у него два одинаковых заместителя — водороды.

Полярные радикалы аминокислот

Перед этим остановимся на одной вещичке. Я писал формулы аминокислот так, как будто они не находятся в растворе. Но если мы заглянем в клетку, pH в цитоплазме которой 7 и 0, то увидим такую картину.

Формула аминокислот в цитоплазме

Еще разок, в цитоплазме клетки pH 7,0, то есть в в ней равное количество H+ и OH—. Так как у азота есть неподеленная электронная пара, то он может присоединить протон водорода по . А остаток кислоты диссоциирует с образованием протона водорода. Понятное дело, что радикалы подчиняются таким же правилам.

Полярные радикалы можно разделить на две группы: полярные незаряженные и полярные заряженные.

Полярные незаряженные радикалы аминокислоты

В этих аминокислотах есть сильно электроотрицательные атомы — азот, кислород и сера. С их помощью молекулы образуют и растворяются в воде. Но заряда у них нет.

Заряд у радикала может быть положительным или отрицательным, поэтому здесь небольшое деление.

Полярные заряженные аминокислоты

Кстати, лучше растворимы в воде заряженные радикалы. Но разница между полярными заряженными и незаряженными не слишком большая. И еще одно — аспартат и глутамат это название аспарагиновой и глутаминовой кислот в растворе.

Аспарагиновая и глутаминовая кислота

Аминокислоты называли по месту их выделения или физическим свойствам, поэтому у них такие странные названия. Гликос с греческого — сладкий, вот и глицин сладковат. Так что придется зазубрить это.

Как придумывать идеи для мемов

Вряд ли существует формула идеального мема. Он просто должен быть смешным и откликаться у читателей/подписчиков. Не можете придумать ничего стоящего?

В то же время практически все мемы строятся по определенным принципам. Опираясь на них, выдумывать мемы будет чуть проще.

Жизнь. Основа большинства мемов — это жизненные ситуации, с которыми наверняка сталкивался читатель. Людям нравится узнавать себя с мыслью «О, да, точно». Для создания такого мема нужно понимать целевую аудиторию и ее проблемы.

Утрирование. Гиперболизация во всей красе. Суть в том, чтобы довести ситуацию в меме до нереального крайнего предела. 

Стоковые фото. За основу берутся стоковые фото с классически идеальными персонажами, а автор помещает героев в какую-то глупую или абсурдную ситуацию.

Абсурд. Когда ничего непонятно, но почему-то очень смешно. И даже трудно объяснить, что происходит.

Пептидная связь

У пептидной связи есть свои секретики, но мы не дадим ей хранить их просто так. Главный секрет в том, что двойная связь находится не у кислорода, а у азота… Хотя это не совсем двойная связь, но близка к ней. Как же это происходит? У азота есть неподеленная электронная пара, электроны могут перейти от азота к кислороду, а двойная связь перейдет от кислорода к азоту — неплохой такой обменчик. Это явление называется резонанс пептидной связи, именно из-за него во всех учебниках пишут про «частично-двойной характер пептидной связи».

Резонанс пептидной связи

Пойдем еще немного дальше, о чем нам говорит двойная связь? Правильно, о гибридизации углерода — она здесь. А значит угол между связями углерода 120 градусов, здесь они не прямо 120 градусов, но близки к этому. Идем дальше. Азот здесь тоже в sp2 гибридизации, понятно какие углы и у него. Но к чему я это все? Ах да, как будет выглядеть молекула?

Структура пептидной связи

Так как все углы по 120 градусов, то все 6 атомов — 3 углерода, азот, водород и кислород, лежат в одной плоскости, как будто на ладошке. За счет того, что углерод и азот образуют две связи — одну пи и одну сигму, вращение вокруг этих связей практически невозможно. Но об этом чуть позже, сейчас давайте упростим эту схему.

Пептидная связь — 6 атомов лежат в одной плоскости

Это мы сделали только с одной пептидной связью, но что если добавить вторую? Получится кое что интересненькое

Плоскости пептидной связи

Следующая пептидная связь такая же, как и предыдущая. Получается, что опять 6 атомов лежат в одной плоскости, вы видите, что один атом углерода принадлежит сразу к двум плоскостям и это удивительно! Можно даже подумать, что все эти пептидные связи будут лежать в одной и той же плоскости, но это не так, а виной этому — вращение вокруг связей.